Los equipos mexicanos iniciaron su participación como invitados en la Libertadores 1998, llegando a lo más alto Cruz Azul en 2001, al perder por penales contra Boca Juniors, y en 2010 Chivas de Guadalajara, que cayó ante Internacional de Porto Alegre.

En 2000 y 2008 América de México se quedó en la semifinal: estuvo a pocos minutos de eliminar al Boca de Carlos Bianchi y después cayó con la Liga Deportiva Universitaria de Quito, que finalmente sería campeón de aquella edición.

En tanto, en las ediciones 2005 y 2006, Chivas arribó a semifinales, pero resultó eliminado por los equipos brasileños Atlético Paranaense y San Pablo, respectivamente.

Por su parte Tigres hizo su debut en la Libertadores 2005 y pasó como primero la fase inicial; luego eliminó a Once Caldas de Colombia y cayó en cuartos de final ante San Pablo, tras un 0-4 de visitante y una victoria 2-1 de local que no le alcanzó.

El equipo de Monterrey volvió a pasar la fase inicial en 2006, tras ser segundo de Corinthians, pero en la primera etapa eliminatoria perdió por penales con Libertad de Paraguay después de igualar sin goles la los dos partidos de la serie.

En 2012 fue la tercera participación en la Copa del conjunto regiomontano, pero no pasó de la fase preliminar, pues fue eliminado por Unión Española de Chile antes de la fase de grupos luego de perder por 1-0 en el encuentro de ida e igualar en dos tantos en el segundo partido.